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核酸适配体筛选服务

卡梅德生物(KMD Bioscience)提供的适体体外筛选服务可以为客户快速、准确的筛选出具有高亲和力、高特异性的适配体,为客户的实验项目节省成本。我们通过指数富集 (SELEX) 方法灵活利用配体系统的自然进化(比如:SELEX法可以识别不同的细胞或检测两类细胞的分子水平差异),提供一站式体外适配体筛选服务。

适体是短的 20–80 nt 单链 DNA 或 RNA 序列或蛋白质,因其三维结构具有亲和力高、特异性高的特点,所以用来结合目标分子。因为RNA序列可以在实验室中通过体外转录合成,所以RNA 序列构成了核酸适体的大部分。并且带有 2'-OH,可能会比单链 DNA 分子提供更多样化的二级结构。

适体是单链核酸(DNA 或 RNA),可以高亲和力和特异性结合预定的靶标。它们可被定义为“人工抗体”,已广泛应用于生命科学基础研究、临床诊断和药物开发等领域。卡梅德生物组织了一批在适体体外筛选服务方面积累了丰富经验的优秀专家,可为客户提供高质量的适体体外筛选服务

 

指数富集法(SELEX):

 

SELEX 是一种体外方法,广泛用于从随机单链核酸序列文库中选择与目标配体特异性结合的单链 DNA 或 RNA(也称为适体)的寡核苷酸。SELEX技术的基本流程主要包括:1)体外化学合成单链寡核苷酸文库;2) 将随机化文库与目标配体混合以允许寡核苷酸-目标结合;3) 洗去未与目标配体结合的核酸分子;4) 洗脱结合的适体;5) 通过 PCR 方法扩增结合的适体以生成二级文库用于下一轮筛选;6)重复步骤(2)-(5),获得与目标配体具有高亲和力和高特异性的适配体。卡梅德生物提供的适体体外筛选技术,在对蛋白质(细胞,小分子多肽)的适体筛选的实验中,能快速筛选出候选靶分子。

利用SELEX法,卡梅德生物的科学家客户提供适体体外筛选服务,如:蛋白质的适体筛选(细胞的适体筛选等),客户只提供靶标蛋白或相关序列或序列号,卡梅德生物将对靶标蛋白进行SDS-PAGE检测,之后进行蛋白文库的制作与靶蛋白筛选,然后解离筛选的适配体,重复洗脱筛选,经PCR,NGS测序,最后合成适配体。卡梅德生物也为客户提供一站式服务,从基因分析合成---蛋白表达纯化---适体体外筛选,为客户的实验提供有力的支撑。

 

 

图1 SELEX方法的典型程序

 

服务范围:

 

卡梅德生物提供的服务包括:

--用于适体开发的基于蛋白质的 SELEX 服务

--用于适体开发的基于全细胞的 SELEX 服务

--用于适体开发的基于活体动物的 SELEX 服务

--用于适配子开发的适配子对开发服务

 

服务内容:

 

服务项目

内容

周期

单链DNA文库制作

* 化学合成一个定制的寡核苷酸文库,由随机生成的固定长度序列组成,两侧是恒定的 5' 和 3' 末端作为引物

1周

体外选择

* 靶标孵育、结合序列洗脱和扩增;重复以上步骤3~4次

4-5周

NGS测序

* 利用NGS测序、生物信息学和生物物理方法获取候选人的基本信息

2周

适体合成

* 通过 HPLC 进行高质量适体合成和纯化,并提供 MS 报告

1周

修改

* 不同的需求和应用选择了不同的改性方法,如生物素、5'-NH 2、5'-硫醇、荧光染料……

2周

结合亲和力测试

* BLISPR等技术,用于KD测定

1周

 

 

客户提供:

 

样品

样品要求

蛋白

* 不含大标签;缓冲液无游离氨基;PBS缓冲液,不含Tris;纯度>95%

* 蛋白0.5-1mg,浓度1mg/ml

小分子物质

* 水溶性好>1mM

* 稳定:不易氧化,不易分解等

* 稀释热不易过高

* 纯度>95%

* 样品量不少于10mg

细胞与细菌

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交付内容:

 

--交付完整的实验报告以及客户指定的适配体序列

 

服务优势:

 

--多年从事适配体开发的优秀科研人员

--比常规适体具有更高的结合亲和力,蛋白靶标的适体亲和力可以达到pM级别。

--保证型交付周期促进项目成功

 

如何订购?

 

 

如果您对我们的服务项目感兴趣,请直接拨打热线电话:+86-400-621-6806或发送邮件至info@kmdbioscience.com