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SNP检测服务

卡梅德生物拥有完善的分子生物学和免疫学检测试验平台,能够为广大用户提供分子杂交服务,包括斑点杂交实验,免疫印迹,QPCR和SNP检测等服务。

 

分子生物学服务 — SNP检测服务

单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism, SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每500-1000个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。SNP被广泛用于群体遗传学研究(如生物的起源、进化及迁移等方面)和疾病相关基因的研究,是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据,在药物基因组学、诊断学和生物医学研究中起重要作用。SNP检测技术已经很成熟,主要检测方法包括直接测序法、TapMan探针法、HRM法及Illumina BeadXpress法。卡梅德生物为您提供高效、准确、价优的SNP检测技术服务,包括从实验设计、样本准备、位点检测到数据分析。我们可根据您的样本和位点的数量选择合适的实验方法,保证实验结果的真实可靠性,旨在为您的SNP分型研究提供完美的解决方案。

 

直接测序法:在SNP的检测方法中,通过PCR扩增后直接测序是十分有效的方法,被公认为是SNP检测的“金标准”。在测序峰图中,纯合型SNP的测序峰为单一峰型,而杂合型的为双峰,所以非常容易区分。采用这种方法,SNP检出率接近100%。本方式适合于样品数和检测位点都不多的情况。

 

TaqMan探针法:针对染色体上的不同SNP位点分别设计PCR引物和TaqMan探针,进行实时荧光PCR扩增。探针的5’-端和3’-端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶液中存在PCR产物时,该探针与模板退火,即产生了适合于核酸外切酶活性的底物,从而将探针5’-端连接的荧光分子从探针上切割下来,破坏两荧光分子间的PRET,发出荧光。通常用于大量样本少量SNP位点分析。这种方法可以直接在实验结果中读出每个样本中SNP的基因型(纯合子XX或YY,杂合子XY),不需要再对序列进行分析,具有直观性。Taqman探针法通常用于少量SNP位点分析,具有成本低、速度快的优点。

 

 

SNPSHOT法:该技术由美国Applied Biosystems Inc(ABI)开发,是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于10-30个SNP位点分析。

 

MassARRAY法:Sequenom公司的MassArray质谱系统在SNP分型市场上占有重要地位,是目前市场上拥有最高性价比的中高通量SNP分型检测系统,通过激光激发DNA分子片段,再用飞行时间来判断片段分子量的大小。该方法已经广泛地应用于遗传突变检测、SNP分型,是目前唯一采用质谱法进行直接检测的设备。 MassARRAY法实验设计灵活,分型结果准确性高,性价比高。可对数百至数千份样本检测,样本通量从几百到几万。是中高通量SNP分型服务性价比最优的分型方法,适用于GWAS实验后续验证以及关联分析。

 

客户提供:

*客户可提组织>50mg,细胞>106,血液>1ml,DNA>1ug (OD260/280>1.8)

 

交付结果:

*测序结果原始数据、整理后数据和分型结果

*完整项目报告